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Se revela el genoma más "recodificado" del mundo

Se revela el genoma más

Los biólogos sintéticos crearon el genoma más "recodificado" del mundo. Jason Chin y sus colegas del Laboratorio de Biología Molecular del Consejo de Investigación Médica de Inglaterra en Cambridge describieron su avance en la revista Nature.

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El equipo tiene una muestra de Escherichia coli que crece en su laboratorio y que tiene un genoma completamente diferente al de cualquier otra cepa de la misma bacteria. Entonces, ¿qué hicieron? Todos los organismos de la tierra utilizan el mismo sistema para organizarse.

Haz que la naturaleza sea más eficiente

Los codones son combinaciones de tres letras de las A, T, C y G del ADN que especifican los aminoácidos en proteínas. Todos los organismos que hemos encontrado utilizan los mismos 64 codones disponibles para ellos.

Por ejemplo, el codón GCA especifica serina, AAG especifica lisina. Pero AGT también significa serina, al igual que AGC, TCT, TCC y TCG. Entonces, de alguna manera, la naturaleza puede verse como ineficiente ya que en realidad podría reducir y usar solo 20 codones para 20 aminoácidos, más uno para "detener".

Avance para la biología sintética

Los codificadores como Chin hacen algo como esta transmisión, pero eliminan los codones redundantes y les asignan nuevas funciones. En un proceso increíblemente minucioso, Chin y sus colegas reemplazaron cada aparición del codón TCG de serina con AGC, cada TCA (también serina) con AGT y cada TAG (parada) con TAA, para un total de 18.214 reemplazos.

Chin señala que hay varias formas de hacer esta princesa, pero en cualquier método, las bacterias deben permanecer vivas. Pudo idear un método para mantener viva a la E. coli a pesar de usar solo 59 codones en lugar de los 61 que ocurren naturalmente para producir los 20 aminoácidos, y dos codones en lugar de los tres de la naturaleza para decir que se detenga.

El avance abrirá las puertas a nuevos tipos de recodificación de genomas para su uso en investigación, así como posibles aplicaciones médicas.